电导检测是离子色谱检测方式中最常用的一种。由于电导池中的等效电容的影响，施加到电导池上的电压和电流之间的关系是非线性的，这给丈量电导值带来很大困难。另外，活动相中本底电导值很高，从较大的背景值中正确丈量待测组分的信号，也是电导检测中的重要题目。目前采用较多的方法有：双极脉冲化学抑制型电导检测、五电极检测和模拟信号交流锁相放大等技术。
一、双极脉冲电导检测
采用可变频率双极脉冲化学抑制型电导检测方式，以美国Dionex公司为代表。该检测方式有效地抑制了电导池等效电容和活动相本底电导的影响，测定灵敏度高，线性范围宽，稳定性好。
它采用8085芯片作为中心处理器(CPU)，通过处理机输进输出部件(PIO)对其他单元进行控制，由CPU时钟分频触发后产生双极脉冲，经整形后送至电导池；电导池返回的信号在第二个脉冲后被采样，并转换为一个直流信号，此信号与温度测定信号交替送进电压频率变换器，数字信号送至CPU。在进行补偿时，CPU将这个信号处理后，通过D／A(补偿)转换器，送回放大电路，对原信号进行补偿，直至比较输出呈”OK”状态。信号的输出也是通过V／F变频电路送至CPU，CPU对其处理后通过D／A(输出)变频电路，经驱动器输出至数据处理器。
二、五电极电导检测
采用五电极电导丈量技术，能有效地消除双电层电容和电解效应的影响。其结构特点是在流路上设置4个电极，在电路设计中维持两丈量电极间电压恒定不受负载电阻、电极间电阻和双电层电容变化的影响。因此，两丈量电极间的电流变化，可从负载电阻两端取出信号进行放大和显示。第五电极为屏蔽电极，它有助于进步丈量的稳定性。五电极式电导检测器有效地消除了极化和电解效应的影响，在高背景电导下仍能获得极低的噪声水平，适合作非化学抑制型电导检测器。
此外，离子色谱还可以采用紫外、可见光、荧光、安培等高效液相色谱常用的检测器，其原理与常规的高效液相色谱检测相似。
